Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1B9

Galnt18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt18Q8K1B9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Galnt18Q8K1B9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Galnt18Q8K1B9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Galnt18Q8K1B9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Galnt18Q8K1B9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms