Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx30Q8CE50 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx30Q8CE50 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx30Q8CE50 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx30Q8CE50 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx30Q8CE50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx30Q8CE50 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx30Q8CE50 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx30Q8CE50 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx30Q8CE50 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx30Q8CE50 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx30Q8CE50 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms