Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim9Q8C7M3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim9Q8C7M3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim9Q8C7M3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim9Q8C7M3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim9Q8C7M3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim9Q8C7M3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim9Q8C7M3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim9Q8C7M3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms