Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Apol7cQ8C6E1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol7cQ8C6E1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol7cQ8C6E1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol7cQ8C6E1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms