Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ubqln3Q8C5U9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ubqln3Q8C5U9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ubqln3Q8C5U9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ubqln3Q8C5U9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ubqln3Q8C5U9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubqln3Q8C5U9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Ubqln3Q8C5U9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubqln3Q8C5U9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ubqln3Q8C5U9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ubqln3Q8C5U9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ubqln3Q8C5U9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubqln3Q8C5U9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ubqln3Q8C5U9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ubqln3Q8C5U9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubqln3Q8C5U9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubqln3Q8C5U9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubqln3Q8C5U9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubqln3Q8C5U9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ubqln3Q8C5U9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ubqln3Q8C5U9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ubqln3Q8C5U9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ubqln3Q8C5U9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubqln3Q8C5U9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubqln3Q8C5U9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubqln3Q8C5U9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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