Protein–RNA interactions for Protein: Q8C428

Tmc7, Transmembrane channel-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc7Q8C428 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc7Q8C428 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc7Q8C428 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc7Q8C428 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc7Q8C428 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc7Q8C428 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms