Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc90bQ8C3X2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc90bQ8C3X2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms