Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8C1R3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8C1R3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q8C1R3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8C1R3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8C1R3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8C1R3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q8C1R3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8C1R3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8C1R3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8C1R3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8C1R3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8C1R3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms