Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X7

Slco6c1, Solute carrier organic anion transporter family, member 6c1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6c1Q8C0X7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slco6c1Q8C0X7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slco6c1Q8C0X7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco6c1Q8C0X7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco6c1Q8C0X7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco6c1Q8C0X7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slco6c1Q8C0X7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco6c1Q8C0X7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6c1Q8C0X7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco6c1Q8C0X7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco6c1Q8C0X7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms