Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Kdm4aQ8BW72 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm4aQ8BW72 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm4aQ8BW72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms