Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup54Q8BTS4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup54Q8BTS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup54Q8BTS4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup54Q8BTS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup54Q8BTS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms