Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcaf1Q8BNE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcaf1Q8BNE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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Tcaf1Q8BNE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf1Q8BNE1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
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Tcaf1Q8BNE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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Tcaf1Q8BNE1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf1Q8BNE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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