Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c4Q8BMQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c4Q8BMQ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms