Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
6820408C15RikQ8BJX2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
6820408C15RikQ8BJX2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
6820408C15RikQ8BJX2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
6820408C15RikQ8BJX2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms