Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdca8Q8BHX3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdca8Q8BHX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdca8Q8BHX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdca8Q8BHX3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdca8Q8BHX3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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