Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8BGN9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8BGN9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BGN9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8BGN9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8BGN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8BGN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8BGN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BGN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8BGN9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BGN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8BGN9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BGN9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BGN9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8BGN9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8BGN9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms