Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8BGC1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8BGC1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGC1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGC1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGC1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8BGC1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8BGC1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8BGC1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGC1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms