Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhot1Q8BG51 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhot1Q8BG51 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhot1Q8BG51 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhot1Q8BG51 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms