Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M10.3Q85ZW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M10.3Q85ZW6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M10.3Q85ZW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M10.3Q85ZW6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M10.3Q85ZW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.3Q85ZW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-M10.3Q85ZW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.3Q85ZW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms