Protein–RNA interactions for Protein: Q810P3

Cdkn3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn3Q810P3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn3Q810P3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkn3Q810P3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn3Q810P3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn3Q810P3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn3Q810P3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms