Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR3

Skida1, SKI/DACH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skida1Q80YR3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skida1Q80YR3 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skida1Q80YR3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skida1Q80YR3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skida1Q80YR3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms