Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Thnsl2Q80W22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Thnsl2Q80W22 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thnsl2Q80W22 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thnsl2Q80W22 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms