Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpp38Q80UU2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpp38Q80UU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpp38Q80UU2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpp38Q80UU2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpp38Q80UU2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rpp38Q80UU2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpp38Q80UU2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms