Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp8Q80U87 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp8Q80U87 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp8Q80U87 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms