Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna12Q80SS5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna12Q80SS5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms