Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rph3alQ768S4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rph3alQ768S4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms