Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms