Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrn2Q6PHP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrn2Q6PHP6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrn2Q6PHP6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrn2Q6PHP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrn2Q6PHP6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms