Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc82Q6PG04 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc82Q6PG04 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc82Q6PG04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc82Q6PG04 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms