Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfrlQ6PE55 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfrlQ6PE55 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfrlQ6PE55 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfrlQ6PE55 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms