Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3bQ6PDC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc3bQ6PDC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms