Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trak1Q6PD31 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trak1Q6PD31 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trak1Q6PD31 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trak1Q6PD31 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trak1Q6PD31 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trak1Q6PD31 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trak1Q6PD31 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trak1Q6PD31 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trak1Q6PD31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trak1Q6PD31 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms