Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn7Q6P5G6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn7Q6P5G6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn7Q6P5G6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn7Q6P5G6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn7Q6P5G6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn7Q6P5G6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn7Q6P5G6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn7Q6P5G6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn7Q6P5G6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn7Q6P5G6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn7Q6P5G6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms