Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmnd1Q6P3A1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmnd1Q6P3A1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmnd1Q6P3A1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmnd1Q6P3A1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmnd1Q6P3A1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stmnd1Q6P3A1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms