Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1Q6NXH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1Q6NXH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpbp1Q6NXH3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpbp1Q6NXH3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpbp1Q6NXH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 544.7 ms