Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ltv1Q6NSQ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ltv1Q6NSQ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ltv1Q6NSQ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ltv1Q6NSQ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltv1Q6NSQ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms