Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5416Q6IE28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5416Q6IE28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5416Q6IE28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5416Q6IE28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5416Q6IE28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5416Q6IE28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5416Q6IE28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms