Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fan1Q69ZT1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fan1Q69ZT1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fan1Q69ZT1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fan1Q69ZT1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fan1Q69ZT1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fan1Q69ZT1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fan1Q69ZT1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fan1Q69ZT1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fan1Q69ZT1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fan1Q69ZT1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fan1Q69ZT1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fan1Q69ZT1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms