Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp1Q62442 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vamp1Q62442 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms