Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sall3Q62255 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sall3Q62255 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sall3Q62255 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sall3Q62255 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sall3Q62255 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms