Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim21Q62191 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim21Q62191 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim21Q62191 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms