Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3bQ62177 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3bQ62177 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema3bQ62177 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3bQ62177 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms