Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprrQ62132 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprrQ62132 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprrQ62132 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprrQ62132 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms