Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AlcamQ61490 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlcamQ61490 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AlcamQ61490 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms