Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift88Q61371 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift88Q61371 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift88Q61371 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift88Q61371 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift88Q61371 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms