Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b2Q61206 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pafah1b2Q61206 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pafah1b2Q61206 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pafah1b2Q61206 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pafah1b2Q61206 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pafah1b2Q61206 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms