Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stip1Q60864 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stip1Q60864 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stip1Q60864 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stip1Q60864 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stip1Q60864 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stip1Q60864 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stip1Q60864 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stip1Q60864 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms