Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf3Q60803 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf3Q60803 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3Q60803 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms