Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr1h2Q60644 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr1h2Q60644 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h2Q60644 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms