Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm1Q60636 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm1Q60636 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm1Q60636 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms